MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba plasmid pHac1

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008230	A	6	6	13	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008230	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008230	A	7	7	38	44	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008230	A	7	7	67	73	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008230	A	8	8	138	145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008230	T	8	8	161	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008230	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008230	GTT	2	6	202	207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008230	TGAT	2	8	209	216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008230	TTTC	2	8	799	806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008230	GAAT	2	8	819	826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008230	ATC	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008230	T	6	6	855	860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008230	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008230	AAC	2	6	944	949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008230	TCCAA	2	10	1026	1035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008230	A	6	6	1234	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008230	AAAACT	2	12	1246	1257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008230	GTT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008230	T	7	7	1288	1294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008230	T	6	6	1297	1302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008230	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008230	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008230	TAA	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008230	TAG	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008230	A	8	8	1742	1749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008230	TAA	2	6	1761	1766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008230	TATT	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008230	AAC	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008230	A	7	7	3555	3561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008230	TTC	2	6	3562	3567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008230	CTAA	2	8	3581	3588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008230	A	6	6	3587	3592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008230	T	6	6	3599	3604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008230	CTAA	2	8	3609	3616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008230	A	6	6	3625	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008230	A	6	6	3639	3644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.